摘要：目的應(yīng)用綜合生物信息學(xué)來識(shí)別骨肉瘤中涉及的肺轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵致病基因并揭示潛在的分子機(jī)制。方法GSE85537的表達(dá)譜從Gene Expression Omnibus(GEO)數(shù)據(jù)庫(kù)下載,該數(shù)據(jù)庫(kù)包含6個(gè)樣品,包括3個(gè)原位骨肉瘤樣品和3個(gè)骨肉瘤肺轉(zhuǎn)移樣品。整理微陣列數(shù)據(jù)集以獲得差異表達(dá)的基因(DEG),并通過生物信息學(xué)方法進(jìn)行深入分析。利用基因本體論(GO)和京都百科全書基因和基因組(KEGG)途徑對(duì)DEGs富集并通過DAVID在線進(jìn)行分析。DEG的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)由STRING數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建。MCODE分析通過Cytoscape軟件中的MCODE插件制作。關(guān)鍵基因的生存分析通過在線(www.ualcan.path.edu/index.html)分析獲得。結(jié)果從GEO數(shù)據(jù)集中共鑒定出差異基因662個(gè),其中234個(gè)基因被上調(diào),428個(gè)基因被下調(diào),通過基因拓?fù)鋵W(xué)分析從PPI網(wǎng)絡(luò)中鑒定出DEG中最密切相關(guān)的137個(gè)基因。其中38個(gè)基因被上調(diào),99個(gè)基因被下調(diào)。GO分析表明DEGs的生物學(xué)功能主要集中在血管生成,轉(zhuǎn)錄中RNA聚合酶II啟動(dòng)子的正向調(diào)節(jié)。主要的細(xì)胞成分包括外泌體和細(xì)胞外基質(zhì)。分子功能包括ATP結(jié)合。KEGG通路分析顯示這些DEG主要參與PI3K-Akt信號(hào)通路和腫瘤信號(hào)通路。MCODE插件分析從PPI網(wǎng)絡(luò)中檢測(cè)到3個(gè)重要模塊,此外選擇了15個(gè)具有高度關(guān)聯(lián)性的差異基因,并經(jīng)過總體存活率和相關(guān)性分析,發(fā)現(xiàn)基因ACTA2可能在防治骨肉瘤肺轉(zhuǎn)移中發(fā)生作用。結(jié)論利用生物信息學(xué)分析篩查骨腫瘤轉(zhuǎn)移前后的DEGs和通路可以幫助了解骨肉瘤轉(zhuǎn)移發(fā)生的分子機(jī)制,對(duì)早期診斷和預(yù)防骨肉瘤轉(zhuǎn)移具有臨床意義,并提供有效的指導(dǎo)治療骨肉瘤轉(zhuǎn)移的聯(lián)合用藥。